上海星晨儿童医院外科依托复旦大学附属儿科医院儿童外科技术力量，实行医疗标准、诊疗规范与儿科医院总院一致的同质化管理，是上海星晨儿童医院重点打造的集诊疗、手术、康复于一体的综合性儿童外科中心。

科室目前汇聚了上海市优质的儿童外科资源，包括复旦大学附属儿科医院、上海交通大学医学院附属新华医院、上海市儿童医院、上海交通大学医学院附属仁济医院等众多三甲医院专家定期出诊、手术，构建出高水平多学科协作的诊疗体系。科室人才梯队完善，现有主任医师 4 人、副主任医师 11 人、住院医师 3 人，临床经验丰富，诊疗技术先进。

诊疗范围覆盖普通外科、泌尿外科、骨科、胸外科等常见病与多发病，专注儿童先天畸形、创伤、感染、肿瘤等外科疾病的规范化诊治，以微创技术与儿童友好诊疗为特色，能够为0-18岁儿童青少年提供安全、舒适的外科医疗服务。